Automatized detection of duplicated copies from NGS data: Application to 45S rDNA and coding genes in the hexaploid Spartina maritime (Poaceae)

Julien Boutte (1) , Benoit Aliaga , Julie Ferreira de Carvalho (1, 2) , Oscar Lima (1) , Sophie Coudouel (3) , Delphine Naquin (3) , Patrick Wincker (4) , Julie Poulain (5) , Corinne da Silva , Malika Ainouche (1) , Armel Salmon (1)

1 ECOBIO - Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes]
2 Nederlands Instituut Voor Ecologie - NIOO (NETHERLANDS)
3 GEF - Plateforme Génomique Environnementale et Fonctionnelle
4 Commissariat à l'Energie Atomique
5 IG - Institut de Génomique d'Evry

Domaines: Biodiversité et Ecologie

Julien Boutte, Benoit Aliaga, Julie Ferreira de Carvalho, Oscar Lima, Sophie Coudouel, et al.. Automatized detection of duplicated copies from NGS data: Application to 45S rDNA and coding genes in the hexaploid Spartina maritime (Poaceae). Rencontres ALPHY/PhyloSIB, Feb 2013, Lyon, France. ⟨hal-01108442⟩