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Poster communications
Automatized detection of duplicated copies from NGS data: Application to 45S rDNA and coding genes in hexaploid Spartina species (Poaceae)
Julien Boutte
1
Benoit Aliaga
Julie Ferreira De Carvalho
1
Oscar Lima
1
Sophie Coudouel
2
Delphine Naquin
2
Patrick Wincker
3
Julie Poulain
4
Corinne da Silva
Malika L.Ainouche
Armel Salmon
1
1
ECOBIO - Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (Bâtiment 14 - Université de Rennes 1 - Campus de Beaulieu - CS 74205 - 35042 Rennes Cedex - France - France)
- UR1 - Université de Rennes 1 (2 rue du Thabor - CS 46510 - 35065 Rennes cedex - France)
- UNIV-RENNES - Université de Rennes (France)
- INEE - Institut Ecologie et Environnement (3 rue Michel-Ange, 75794, Paris cedex 16, France - France)
- OSUR - Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (263 avenue du Général Leclerc - 35042 Rennes cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR6553 (France)
2
GEF - Plateforme Génomique Environnementale et Fonctionnelle (BioGenOuest Rennes Cédex - France)
- OSUR - Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (263 avenue du Général Leclerc - 35042 Rennes cedex - France)
3
Commissariat à l'Energie Atomique (France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
4
IG - Institut de Génomique d'Evry (2 rue Gaston Crémieux CP5706 91057 EVRY CEDEX - France)
- JACOB - Institut de Biologie François JACOB : DRF/JACOB (DRF
CEA
Fontenay-aux-Roses - France)
- DRF (CEA) - Direction de Recherche Fondamentale (CEA) : DRF/JACOB (Direction de Recherche Fondamentale
Fundamental Research Division
CEA Saclay
91191 Gif-sur-Yvette
- France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- DRF (CEA) - Direction de Recherche Fondamentale (CEA) : DRF/JACOB (Direction de Recherche Fondamentale
Fundamental Research Division
CEA Saclay
91191 Gif-sur-Yvette
- France)
- Université Paris-Saclay (Espace Technologique, Bat. Discovery - RD 128 - 2e ét., 91190 Saint-Aubin - France)
Document type :
Poster communications
Domain :
Complete list of metadatas
https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01110201
Contributor : Valerie Briand <>
Submitted on : Tuesday, January 27, 2015 - 4:27:27 PM
Last modification on : Thursday, January 14, 2021 - 11:50:51 AM
Contributor : Valerie Briand <>
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Last modification on : Thursday, January 14, 2021 - 11:50:51 AM
Identifiers
- HAL Id : hal-01110201, version 1
Collections
UNIV-RENNES1 | CEA | CNRS | OSUR | ECOBIO | UR1-UFR-SVE | UNIV-RENNES | JACOB | CEA-DRF
Citation
Julien Boutte, Benoit Aliaga, Julie Ferreira De Carvalho, Oscar Lima, Sophie Coudouel, et al.. Automatized detection of duplicated copies from NGS data: Application to 45S rDNA and coding genes in hexaploid Spartina species (Poaceae). International Conference of Ployploidy, Hybridization and Biodiversity (ICPHB), May 2012, Prague, Czech Republic. ⟨hal-01110201⟩
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