The ReproGenomics Viewer: an integrative cross-species toolbox for the reproductive science community.

Thomas A Darde 1, 2 Olivier Sallou 1 Emmanuelle Becker 2 Bertrand Evrard 2 Cyril Monjoeaud 1 Yvan Le Bras 1 Bernard Jégou 3, 2 Olivier Collin 1 Antoine D. Rolland 2 Frédéric Chalmel 2
1 Plateforme bioinformatique GenOuest [Rennes]
Inria Rennes – Bretagne Atlantique , Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, UR1 - Université de Rennes 1, IRISA - Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires
Abstract : We report the development of the ReproGenomics Viewer (RGV), a multi-and cross-species working environment for the visualization, mining and comparison of published omics data sets for the reproductive science community. The system currently embeds 15 published data sets related to gametogenesis from nine model organisms. Data sets have been curated and conveniently organized into broad categories including biological topics, technologies, species and publications. RGV's modular design for both organisms and genomic tools enables users to upload and compare their data with that from the data sets embedded in the system in a cross-species manner. The RGV is freely available at http://rgv.genouest.org.
Type de document :
Article dans une revue
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2015, 43, pp.8. 〈10.1093/nar/gkv345〉
Liste complète des métadonnées

Littérature citée [49 références]  Voir  Masquer  Télécharger

https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01146120
Contributeur : Laurent Jonchère <>
Soumis le : lundi 27 avril 2015 - 16:40:13
Dernière modification le : vendredi 16 novembre 2018 - 01:31:11
Document(s) archivé(s) le : lundi 14 septembre 2015 - 14:07:02

Fichier

nar.gkv345.full.pdf
Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte

Identifiants

Citation

Thomas A Darde, Olivier Sallou, Emmanuelle Becker, Bertrand Evrard, Cyril Monjoeaud, et al.. The ReproGenomics Viewer: an integrative cross-species toolbox for the reproductive science community.. Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2015, 43, pp.8. 〈10.1093/nar/gkv345〉. 〈hal-01146120〉

Partager

Métriques

Consultations de la notice

639

Téléchargements de fichiers

776